El IAIP supervisa 470 instituciones de la administración pública, lo que incluye 298 municipalidades, entidades autónomas, descentralizadas y los tres poderes del Estado.
Entre las dependencias con déficit de ejecución están Infraestructura y Transporte, la Cree, Invest-H, Banasupro, Sanaa, Inam, Mi Ambiente, Ihma, IP, Senprende, Marina Mercante.