"San Juana" se destacó especialmente en sus enfrentamientos contra el Cártel de Santa Rosa de Lima, dirigido por José Antonio Yépez Ortiz, alias "El Marro". Este grupo delictivo, inicialmente involucrado en el robo de combustible (huachicoleo) y asaltos a camiones de carga, se convirtió en uno de los principales rivales del CJNG en el estado de Guanajuato.